segunda-feira, 28 de janeiro de 2013

Primeira avaliação Genética Molecular – 2º sem. 2012 28/01/2013 (gabarito e comentários)




1.       (1,5 ponto) - O surgimento da vida na Terra parece ter sido rápido, cerca de 600 milhões de anos após o resfriamento. Mas o estabelecimento de formas de vida diferentes de simples unicelulados levou quase 3 bilhões de anos. Comente como o reparo de DNA pode ter contribuído para esta demora.
O que importa frisar aqui é a perda de informação genética causada pelo meio ambiente e o papel do reparo na manutenção desta informação.

2.       (1,0 ponto)- Ligue os elementos da coluna da esquerda (enzimas do replicossomo de E. coli) com os da esquerda (suas funções).

1
DNA pol III

( 5 )
Auxilia a abertura do DNA relaxando a tensão acumulada nas voltas acima da forquilha de replicação
2
Helicase

( 4 )
Retira os primers e ressintetiza pequenos trechos de DNA, com revisão
3
Primase

( 2 )
Auxilia a quebra das pontes de hidrogênio e separação das fitas, dentro da forquilha de replicação
4
DNA pol I

( 3 )
Adiciona iniciadores de RNA para a síntese da fita contínua e para cada fragmento de Okazaki da fita descontínua
5
Girase

( 1 )
Sintetiza os fragmentos mais longos de DNA e faz revisão da síntese

3.       (1.0 ponto) Na replicação do DNA linear de Streptomyces, um procarioto, o DNA se circulariza pela ligação de suas extremidades. Porque a bactéria faz isso?
O importante aqui é enfatizar o “problema das pontas” e comentar porque o círculo resolve isso.
4.       (1,0 ponto) Os promotores bacterianos clássicos têm uma estrutura conservada. Qual das características abaixo NÂO FAZ PARTE desta estrutura.
a) uma caixa TATA na posição -10
b) o distanciamento de aprox. 20 pb entre duas caixas de consenso
c) um sinal de iniciação da transcrição em torno da posição +1
d) uma caixa com sequencia conservada na posição -35
e) ausência de conservação de sequência entre caixas de consenso

5.       (1,0ponto) Genes eucariotos costumam ter segmentos relativamente longos que serão posteriormente retirados do mRNA maduro. Outros processos são também necessários para gerar o mRNA e localizá-lo junto aos ribossomos. Ligue os elementos da esquerda com os da direita nas colunas abaixo
1
Poliadeninação

(3 )
Retira os introns
2
“capping”

(4 )
Indispensável ao posicionamento do mRNA
3
Splicing

(1 )
Adiciona sequências de adenina na extremidade 3´do mRNA
4
Transporte para o citoplasma

( 2)
Adiciona a base 7-metil-guanosina na extremidade 5´do mRNA



(   )
O processo ocorre no citoplasma
Obs: Todos os processos ocorrem no núcleo ou na sua membrana.
6.       (1,0) Porque aminoácidos mais frequentemente empregados na síntese de proteínas têm mais códons?
Pois isso reduz a chance de que a mutação sobre o códon modifique o aminoácido respectivo. Outra forma de dizer seria: porque aumenta a incidência de mutações silenciosas (mas é uma forma indireta de esclarecer a questão)
7.       (1,0 ponto) O mecanismo de vazamento do operon lac garante seu funcionamento porque:
a)  permite um suprimento basal de b-galactosidase, essencial para manter níveis de ATP mínimos na célula;
b)  permite uma síntese de pequenas quantidades de permease que garante a entrada na célula da lactose, indutor do sistema;
c)  permite a eficiente degradação da lactose que entrar na célula, antes mesmo da síntese de novo de beta-galactosidase;
d)  permite que a produção do repressor seja interrompida pela entrada de pequenas quantidades de lactose;
e)  permite que a degradação do repressor ocorra sempre que houver lactose no meio de cultura.
8.       (1,0 ponto) Indique se as afirmações sobre as várias etapas de regulação gênica em eucariotos são verdadeiras (V) ou falsas (F).
a) a alteração da cromatina é irrelevante (_F_)
b) a formação do complexo transcricional é a etapa mais importante no controle da expressão gênica (_V_)
c) no processamento do mRNA o splicing alternativo é responsável pela expansão do proteoma (_V_)
d) após a produção do mRNA, a célula obrigatoriamente produzirá a proteína codificada (_F_)
e) a partir de um mRNA maduro pode-se produzir proteínas distintas por processamento da cadeia polipeptídica original (_V_)

9.       (1,5 pontos) Assinale V para verdadeiro e F para falso: Gabarito será anexado posteriormente
(       )
A expressão de genes envolvidos na manutenção de células em eucariotos é de regulação constitutiva;
(       )
O processamento alternativo é um tipo comum de controle ao nível de DNA, que permite gerar uma maior variabilidade de proteínas; 
(        )
Elementos regulatórios em eucariotos podem ser proximais ou estar situados a certa distância do gene estrutural;
(        )
Na remodelação da cromatina os nucleossomos são movimentados de forma a disponibilizar as regiões regulatórias, permitindo a transcrição;
(        )
Resíduos de aminoácidos de uma proteína interagem com bases do DNA pelos sulcos da dupla hélice;
(        )
Isoladores impedem que a expressão de um gene contamine a expressão de outro gene vizinho;
(        )
A síntese de ferritina, proteína de estocagem de Fe, é regulada ao nível transcricional e depende da disponibilidade de Fe;
(        )
A edição de RNA é um controle pós-transcricional;
(        )
Quando fatores de transcrição se ligam aos silenciadores, a transcrição de genes que eles controlam é reprimida;
(        )
No processamento alternativo um intron não retirado pode se tornar exon.

quinta-feira, 17 de janeiro de 2013

Calendário das atividades finais da disciplina Genética Molecular – 2º. sem. 2012




16/01
Síntese proteica
21/01
Controle da expressão gênica em procariotos
23/01
Controle da expressão gênica em eucariotos
28/01
1ª. avaliação
30/01
Clonagem gênica – construção de bibliotecas genômicas
04/02
Clonagem gênica – construção de bibliotecas de expressão
06/02
Aplicações em pesquisa e indústria
11/02
Feriado - Carnaval
13/02
Feriado - Carnaval
18/02
PCR – fundamentos
20/02
PCR –aplicações
25/02
RAPD, sequenciamento e outras técnicas – parte I
27/02
RAPD, sequenciamento e outras técnicas – parte II
04/03
2ª. avaliação
06/03
Distribuição dos genes nos genomas – introdução e genomas virais
11/03
Distribuição dos genes nos genomas – procariotos
13/03
Distribuição dos genes nos genomas – eucariotos e organelas
18/03
Prática – estudo online de genes e genomas – Parte I
20/03
Prática – estudo online de genes e genomas – Parte II
25/03
Prática – estudo online de genes e genomas – Parte III
27/03
Feriado - Semana Santa
01/04
Prática – estudo online de genes e genomas – Parte IV
03/04
Prática – estudo online de genes e genomas – Parte V
08/04
Prática – estudo online de genes e genomas – Parte VI
10/04
3ª. avaliação
15/04
Revisão geral da disciplina – aula tira-dúvidas
17/04
Avaliação de reposição
22/04
Revisão geral da disciplina – aula tira-dúvidas
24/04
Avaliação final
29/04
Segunda chamada da avaliação final