terça-feira, 15 de novembro de 2016

Cronograma IBMC turma 2016B

Cronograma IBMC 2016_2 (Parcial)

DIA LETIVO
DATA
ASSUNTO
HORÁRIO
1
9/11
Origem da vida.
9-12 h
2
16/11
Componentes celulares e estrutura dos eucariotos e procariotos; membranas celulares
9-12 h
3
23/07
O núcleo e organização e estrutura dos genes e genoma. Replicação do DNA
9-12 h
4
30/11
Transcrição e processamento
9-12 h
5
07/12
Tradução e Controle da expressão gênica procariotos
9-12 h
6
14/12
Controle da expressão gênica em eucariotos; Técnicas de biologia molecular (PCR, sequenciamento, outras)
9-12 h
7
21/12
1ª. AVALIAÇÃO
9-12 h


sábado, 12 de novembro de 2016

Emergência rápida da vida: novas evidências

O artigo sobre a origem da vida que mencionei na aula está no link abaixo, que deve ser acessado quando o computador ou celular estiver no wireless da UFCG.

O título e autores estão a seguir, assim como o link

Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures
Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend, Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas


terça-feira, 27 de setembro de 2016

Sites e referências para CRISPR-Cas9 (e para gene drive) que explicam o processo de forma mais simplificada



Um texto bastante claro que mostra como funciona a edição: http://www.abc.net.au/news/2016-04-07/crispr-gene-editing-technology-explainer/7217782

Outro bem feito é o da Harvard: http://sitn.hms.harvard.edu/flash/2014/crispr-a-game-changing-genetic-engineering-technique/  que tem também valiosos links do lado direito.

Uma dúvida (desconhecimento, mesmo): como é que se transformam os organismos usando estas enzimas? Neste site tem o caminho prático - http://www.clontech.com/BR/Products/Genome_Editing/CRISPR_Cas9/Resources/CRISPR_Cas9_Gesicles_Overview?sitex=10028:22372:US&PEBCL1=VwkwGagonNRfuk2X5wr3isWu3A&PEBCL1_pses=ZG62BDA5E0C76ED530C683B864608DA30F921905ACF78146E99DFCA29D8D39D00AFDDF40F56B2F0DFA033A8A409A93BBE5C907292A9540E635  Do lado esquerdo do site tem uma série de links técnicos que explicam tudo direitinho que está mostrado no vídeo, mas as “gesicles” não são a única forma de transformar células. Além disso, depois de transformadas, as células precisam regenerar o organismo (se se deseja construir um OGM) ou precisam se multiplicar e diferenciar em muitos diferentes tipos celulares se a ideia é regenerar tecidos ou substituir células num organismo pré-existente (não sei até que ponto isso já é possível). E isso não está explicado.

O artigo que descreve as “gesicles” é este: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3182359/  . Não é o artigo original, mas um comentário, entretanto é muito claro e tem figuras explicativas.

Aplicações veterinárias e outras
Este artigo revê o uso em bovinos - http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-014-9452-6 (via Capes). A leitura não é fácil e para CRISPR e outras endonucleases o assuntosó é tratado da página 23 em diante.

Este link é para revisão em plantas, mas é superior ao de bovinos - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25536441

Pode ser interessante ler esta revisão geral - Genome Editing with Engineered Nucleases in Economically Important Animals and Plants: State of the Art in the Research Pipeline. Sovová T, Kerins G, Demnerová K, Ovesná J. Curr Issues Mol Biol. 2016 Jun 2;21:41-62. [Epub ahead of print] link http://www.horizonpress.com/cimb/v/v21/41.pdf


Depois de ler e ver tudo o que está acima, vale a pena ler a revisão - Genome Engineering with Targetable Nucleases  http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-biochem-060713-035418 , mas tem 35 páginas... Apesar disso, o assunto está muito bem dividido entre as diversas endonucleases e a leitura acaba compensando.

sábado, 10 de setembro de 2016

Alteração do cronograma 2016.1 IBMC

Caros.

Por razão dos bloqueios e do feriado de 12 de outubro, o cronograma da disciplina IBMC teve que ser revisto (http://genmol.blogspot.com.br/2016/07/cronograma-ibcm-20161.html) . Por favor, anotem com cuidado as novas aulas e provas.

quinta-feira, 1 de setembro de 2016

Esta semana a Nature publicou um estudo que mostra bactérias de 3,7 bilhões de anos em sedimentos da Groenlândia, o que confirma evidências indiretas anteriores e está de acordo com o relógio molecular que indica o aparecimento da vida a pouco mais de 4 bilhões de anos.

NATURE | LETTER
Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures
Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend,Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas
Nature (2016) doi:10.1038/nature19355
Received 11 October 2015 Accepted 11 August 2016 Published online 31 August 2016

(Obs: de dentro da rede da UFCG é possível baixar ao artigo na íntegra)

quarta-feira, 6 de julho de 2016

Cronograma IBCM 2016_1




DIA LETIVO
DATA
ASSUNTO
HORÁRIO
1
22/06
Origem da vida: vírus e células; componentes celulares e estrutura dos eucariotos e procariotos
9-12 h
2
29/06
Componentes celulares e estrutura dos eucariotos e procariotos (finalização); membranas celulares
9-12 h
3
06/07
O núcleo e organização e estrutura dos genes e genoma
9-12 h
4
13/07
                                 Replicação do DNA
9-12 h
5
20/07
Transcrição e processamento
9-12 h
6
27/03
Tradução e Controle da expressão gênica procariotos
9-12 h
7
03/08
Controle da expressão gênica em eucariotos
9-12 h
8
10/08
Técnicas de biologia molecular (PCR, sequenciamento, outras)
9-12 h
9
17/08
1ª. AVALIAÇÃO

10
24/08
Mitocôndria e Peroxissomos
9-11 h

31/08
Não houve aulas
9-11 h

07/09
Feriado nacional
9-12 h
11
13/09
Comunicação intercelular e transdução de sinal 
18-20:30 h
12
21/09
Não houve aula
9-12 h
13
27/09
Sistema de endomembranas 
18-20:30 h 
14
28/09
Mitose-Meiose Apoptose
9-12 h
15
05/10
Citoesqueleto
9-12 h
16
11/10
2ª. AVALIAÇÃO
18-20:00h
17
14/10
REPOSIÇÃO
14:00-16:00
18
26/10
EXAME FINAL
9-12 h

Entre o dia 14 e o dia 26 poderá ser agendada uma ou mais assistências com os monitores,

quarta-feira, 8 de junho de 2016

Seimnários da PG BCM - cronograma de apresentações revisto

Todos os seminários devem ter uma abordagem molecular e celular aprofundada. Livros podem ajudar em muitos casos, mas por vezes o assunto só aparece em detalhe em revisões publicadas em revistas especializadas. Cada seminário deverá tomar 40min., exceto o de contração muscular, que pode se estender para 1h30 min. O conjunto de seminários será apresentado em dois dias de aula.


Primeiro bloco (15 de junho à tarde)
Beatriz – Como as células se aderem umas às outras? Desmossomos, gap junctions, etc.

Aline Ferreira – Como se dá o crossing-over na meiose?

Natanael - Como o linfócito T citotóxico dispara a apoptose na célula alvo?

Segundo bloco (16 de junho pela manhã)
Lídio Ricardo - Como se dá o acoplamento do ribossomo à membrana do retículo endoplasmático e qual o destino da proteína sintetizada?



Marília e Raquel – Acoplamento excitação-contração muscular: do sinal elétrico que se propaga no axônio à contração muscular

quinta-feira, 28 de abril de 2016

Seminários da PG - BMC

Para que todos possam ler o assunto e não apenas os responsáveis pelos seminários...

Seminários para o dia 13 de abril
Aline Alves
As hipóteses de origem dos vírus: argumentos (há no blog GenMol uma sinopse traduzida da Nature)
Maria das Graças
Como a cromatina se descondensa e re-condensa na divisão celular em mamíferos (não precisa falar sobre as várias fases da mitose, só o mecanismo molecular da condensação)
Carla Lauise
Como se replicam os vírus HIV e DEN 
Laysa Freire
Cinco exemplos de antibióticos que bloqueiam a tradução e seus mecanismos de ação (Os antibióticos podem ser contra procariotos ou eucariotos)