terça-feira, 27 de setembro de 2016

Sites e referências para CRISPR-Cas9 (e para gene drive) que explicam o processo de forma mais simplificada



Um texto bastante claro que mostra como funciona a edição: http://www.abc.net.au/news/2016-04-07/crispr-gene-editing-technology-explainer/7217782

Outro bem feito é o da Harvard: http://sitn.hms.harvard.edu/flash/2014/crispr-a-game-changing-genetic-engineering-technique/  que tem também valiosos links do lado direito.

Uma dúvida (desconhecimento, mesmo): como é que se transformam os organismos usando estas enzimas? Neste site tem o caminho prático - http://www.clontech.com/BR/Products/Genome_Editing/CRISPR_Cas9/Resources/CRISPR_Cas9_Gesicles_Overview?sitex=10028:22372:US&PEBCL1=VwkwGagonNRfuk2X5wr3isWu3A&PEBCL1_pses=ZG62BDA5E0C76ED530C683B864608DA30F921905ACF78146E99DFCA29D8D39D00AFDDF40F56B2F0DFA033A8A409A93BBE5C907292A9540E635  Do lado esquerdo do site tem uma série de links técnicos que explicam tudo direitinho que está mostrado no vídeo, mas as “gesicles” não são a única forma de transformar células. Além disso, depois de transformadas, as células precisam regenerar o organismo (se se deseja construir um OGM) ou precisam se multiplicar e diferenciar em muitos diferentes tipos celulares se a ideia é regenerar tecidos ou substituir células num organismo pré-existente (não sei até que ponto isso já é possível). E isso não está explicado.

O artigo que descreve as “gesicles” é este: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3182359/  . Não é o artigo original, mas um comentário, entretanto é muito claro e tem figuras explicativas.

Aplicações veterinárias e outras
Este artigo revê o uso em bovinos - http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-014-9452-6 (via Capes). A leitura não é fácil e para CRISPR e outras endonucleases o assuntosó é tratado da página 23 em diante.

Este link é para revisão em plantas, mas é superior ao de bovinos - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25536441

Pode ser interessante ler esta revisão geral - Genome Editing with Engineered Nucleases in Economically Important Animals and Plants: State of the Art in the Research Pipeline. Sovová T, Kerins G, Demnerová K, Ovesná J. Curr Issues Mol Biol. 2016 Jun 2;21:41-62. [Epub ahead of print] link http://www.horizonpress.com/cimb/v/v21/41.pdf


Depois de ler e ver tudo o que está acima, vale a pena ler a revisão - Genome Engineering with Targetable Nucleases  http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-biochem-060713-035418 , mas tem 35 páginas... Apesar disso, o assunto está muito bem dividido entre as diversas endonucleases e a leitura acaba compensando.

sábado, 10 de setembro de 2016

Alteração do cronograma 2016.1 IBMC

Caros.

Por razão dos bloqueios e do feriado de 12 de outubro, o cronograma da disciplina IBMC teve que ser revisto (http://genmol.blogspot.com.br/2016/07/cronograma-ibcm-20161.html) . Por favor, anotem com cuidado as novas aulas e provas.

quinta-feira, 1 de setembro de 2016

Esta semana a Nature publicou um estudo que mostra bactérias de 3,7 bilhões de anos em sedimentos da Groenlândia, o que confirma evidências indiretas anteriores e está de acordo com o relógio molecular que indica o aparecimento da vida a pouco mais de 4 bilhões de anos.

NATURE | LETTER
Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures
Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend,Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas
Nature (2016) doi:10.1038/nature19355
Received 11 October 2015 Accepted 11 August 2016 Published online 31 August 2016

(Obs: de dentro da rede da UFCG é possível baixar ao artigo na íntegra)